有向基因组移位排序问题的O（n^2）快速算法

来源 :计算机学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：bolen9999

【摘要】

：

有向基因组移位排序问题在计算生物学研究中占有重要位置.以前最好的算法时间复杂度为O(n2logn).该文给出一个有向基因组移位排序的新多项式算法,将移位排序的时间复杂度改进

【作者】

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刘晓文朱大铭马绍汉李子茂王鲁生

【机构】

：

山东大学计算机科学与技术学院,香港城市大学计算机科学系

【出处】

：

计算机学报

【发表日期】

：

2004年10期

【关键词】

：

基因组移位排序问题算法计算生物学时间复杂度 genomes translocation computational biology algori

【基金项目】

：

国家自然科学基金，山东省优秀中青年科学家科研奖励基金

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有向基因组移位排序问题在计算生物学研究中占有重要位置.以前最好的算法时间复杂度为O(n2logn).该文给出一个有向基因组移位排序的新多项式算法,将移位排序的时间复杂度改进为O(n2).算法改进的关键在于找到一种寻找有效合理移位的新方法,通过在最小子排列中删除无关顶点确定一个合理移位是否有效,从而将寻找一个有效移位的时间复杂度改进为O(n),总时间复杂度由此降为O(n2).

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