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基于PCR技术检测MRD的方法多种多样，如共同引物和特异引物PCR，RT-PCR，ASO-PCR，SSCP-PCR，荧光PCR结合毛细管电泳技术以及定量的竞争PCR和实时定量．PCR(RQ-PCR)、LightCycle RQ-PCR等。各种方法均有其优缺点及适用情况，合理选择才能获得所需的灵敏度和特异性。