猪肺泡巨噬细胞感染PRRSV进程中差异表达基因及基因功能富集分析

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ceshi110
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
猪呼吸和繁殖综合症病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)感染猪后会引起妊娠母猪严重繁殖障碍和仔猪呼吸困难及高死亡率,给养猪产业造成了巨大经济损失,因此挖掘PRRSV感染猪肺泡巨噬细胞进程中差异表达的基因及机理有重要意义。本研究对来自GEO数据库的PRRSV感染猪肺泡巨噬细胞sage表达谱数据GSE10346进行后续挖掘。先用sage软件处理,经sagemap注释得到上调已知基因49个,下调已知基因41个。利用AgBase网站上的GORetriever工具和GOSlim Viewer工具进行细胞组分(cellular component)、分子功能(molecular function)及参与的生物过程(biological process)分类后发现有4个基因与病毒的复制相关:其中IL8已有报道认为与抗PRRSV相关;TNF-α能够抑制PRRSV复制;PPIA可能与GP5蛋白胞外区中和决定簇与抗体发生作用的24位脯氨酸有关;ICAM-1在嗜中性粒细胞的产生中起关键作用,与病毒吸附相关。这4个基因与PRRSV的致病机制相关,可望用于抗PRRSV研究。进一步利用David在线工具进行基因功能富集分析后,发现几个免疫通路,如趋化因子通路,Toll-like受体信号通路和NOD-like受体信号通路具有检验显著性,这些免疫通路在PRRSV感染过程中起着一定作用,有望成为抗PRRSV的靶通路。
其他文献
对国内一些主要胶种的技术现状和存在问题进行了综述,在此基础上分析了我国胶粘剂行业今后的发展趋势,并讨论了胶粘剂在木材、建筑、基础工程、汽车、涂料、制鞋、纺织印染等
张纯如以日本、中国和西方三个视角围绕南京大屠杀为什么被遗忘展开论述。从日本视角看,大屠杀被遗忘有国际社会的外交和国内的历史教育等因素。从中国视角看,有心理和社会道
近十年来,我国的房地产行业得到了迅猛的发展,也为我国增加了巨大的财政收入。随着我国房地产行业税收政策和相关法律的不断完善,房地产企业也渐渐加强了对税收筹划的关注。
研究了低游离甲醛含量脲醛树脂胶粘剂的合成新工艺,探讨了甲醛/尿素摩尔比、反应温度、pH值、以及加料的顺序等因素对脲醛树脂综合性能的影响,并采用三聚氰胺进行了改性,以提
通过对财政部修订后的《企业会计准则第9号—职工薪酬》的学习,进一步了解了修订后企业有关职工薪酬核算的相关规定及会计处理方法。本文主要是阐述一下新准则修订后和原准则
中草药抗肿瘤作用已成为国内外药物研究的热点,鉴于以毒攻毒类中药有一定类似于西药的毒性特点,自有研究表明三氧化二砷(As2O3)单味注射剂对急性早幼粒细胞白血病有显著的临
本文系统地总结了落后供热企业的现状和通病,详细地阐述了造成其平衡难、能耗高、安全差的多种原因,指出了人工烧锅炉、纯温度管理、集中循环泵模式为代表的三大落后供热方式
目的探讨临床中原发性闭角型青光眼实施超声乳化手术治疗效果及其预后的影响因素。方法将112例原发性闭角型青光眼患者随机分为研究组和对照组,每组分为两个亚组,即急性组和
本文叙述了用皂化法测定EVA树脂中VA含量的原理和操作,特别是对影响测定准确度的主要因素——加水量、加热方式和反应时间进行了探讨。
针对太原热力总公司下属的五个分公司600多座热力站的全网平衡控制、大批量数据采集、监视、Web浏览、移动终端数据访问、分层监控、集中调度管理、大数据量分析、查询及通过