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为评价红三叶种质资源的遗传多样性，筛选生产上有利用价值的育种材料，本研究利用10个表型性状和8个SSR标记对29份来自国内外的红三叶种质进行遗传多样性分析。结果表明，多数表型性状在不同种质材料间具有较大的变异，变异系数为8.45%～42.27%；基于表型性状可将29份红三叶划分为3个类群，类群间在茎节数、茎长度、单株花序数等性状上有较大的分化。8个SSR标记共扩增出58多态性条带，每个位点平均等位基因数为7.25，平均期望杂合度为0.621，多态性信息含量指数0.587，表明了红三叶种质材料间丰富的遗传多样性基于8个SSR标记数据也将29份红三叶划分为3个类群，但每个类群的组成种质与基于表型性状所得到的结果并不完全一致。本研究探讨了红三叶群体间的遗传变异基础，为红三叶种质进一步创新利用提供科学依据。