【摘 要】
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目的:调查1株尿道致病性大肠埃希菌(UPEC)NB8株携带的毒力因子和可能存在的致病机制。方法:UPECNB8株分离自2012年4月宁波市第一医院住院患者尿液标本,做16SrDNA和gyrA基因测序BLA
【机 构】
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宁波市第一医院检验科,无锡市克隆遗传技术研究所生物信息学室,南京医科大学附属无锡人民医院检验科,杭州市余杭区中医院检验科
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目的:调查1株尿道致病性大肠埃希菌(UPEC)NB8株携带的毒力因子和可能存在的致病机制。方法:UPECNB8株分离自2012年4月宁波市第一医院住院患者尿液标本,做16SrDNA和gyrA基因测序BLASTn比对确认为UPEC,用IlluminaHiSeq与IonTorrentPGM这2种大规模并行测序仪进行全基因组分析,再进行人工测序补缺口。再对NB8株做毒力因子数据挖掘和分析,最后把NB8株和9株全基因组测序的UPEC的毒力因子做比较基因组学研究。结果:UPECNB8株全基因组测序得到一条推定的染色
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