【摘 要】
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与阿卡波糖对α-葡萄糖苷酶的竞争性抑制类型不同,L-阿拉伯糖对蔗糖酶的抑制类型为反竞争性抑制,但由于人蔗糖酶结构尚未被实验测定,其抑制的分子机理尚未阐明.文章使用计算
【机 构】
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江南大学 数字媒体学院,江苏无锡,214122;中国药科大学 生命科学与技术学院,江苏南京,210009
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与阿卡波糖对α-葡萄糖苷酶的竞争性抑制类型不同,L-阿拉伯糖对蔗糖酶的抑制类型为反竞争性抑制,但由于人蔗糖酶结构尚未被实验测定,其抑制的分子机理尚未阐明.文章使用计算机辅助同源模建的方法,以人麦芽糖酶-葡糖淀粉酶(Maltase-glucoamylase)碳端亚基的三级结构为模版,模建了人肠道蔗糖酶的结构,并使用分子对接的方法,将L-阿拉伯糖对接到蔗糖酶的活性中心,建立了蔗糖-阿拉伯糖-蔗糖酶三元复合物的结构模型.模拟了两种可能的三元复合物结构,通过计算结合自由能,推断可能的复合物为酶-抑制剂-底物(E-I-S)类型.当底物蔗糖存在时,阿拉伯糖与蔗糖酶的亲和力增加,从而表现出反竞争抑制效果,.该模型可为深入研究其反竞争性抑制的分子机理提供帮助.
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