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我国是世界水产养殖大国，水产养殖的种类繁多，达170多种。该课题以促进我国水产养殖业可持续健康发展、保证国内市场需求、提高国际市场竞争力为目标，以我国水产养殖的重要虾蟹类（中国对虾、斑节对虾、凡纳滨对虾、青虾、河蟹），贝类（栉孔扇贝、海水珍珠贝、淡水珍珠贝）和藻类（海带、紫菜）为研究对象，应用群体选育、家系培育、杂交育种、复合育种等技术手段，结合现代生物育种技术，深入开展材料和品种创新，培育出一批优质、高产、抗病或抗逆的品种或品系；建立比较完善的虾贝藻新品种培育技术体系，推动我国水产育种事业的发展，整体提升我国水产育种技术水平及水产良种覆盖率。