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目的分析我院临床分离非结核分枝杆菌（NTM）菌株,探讨福建省NTM临床分离率和菌种分布情况。方法对我院2009-2012年临床分离6 362株分枝杆菌进行结核分枝杆菌复合群（MTBC）与NTM鉴别,对鉴定为NTM菌株应用hsp65-和rpoB-PCR-RFLP进行菌种鉴定。结果 6 362株临床分离分枝杆菌共鉴别出649株NTM。鉴别出的649株NTM菌株,经hsp65-和rpoB-PCR-RFLP鉴定,菌种分布达24个种,其中菌株数量前3位菌种为：胞内分枝杆菌（M.intracellulare）302株