目的 应用同位素标记的绝对和相对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)技术筛选并鉴定不同预后的胆道闭锁患儿肝脏中表达的差异蛋白质,并进行生物信息学分析.方法 收集Ⅲ型胆道闭锁患儿Kassi手术时肝脏组织,术后对患儿预后进行随访,根据3个月时黄疸是否消退和自体肝存活时间,将标本筛选并分为两组,预后较好组(术后3个月时血清总胆红素≤25 μmol/L,自体肝存活时间≥2年)和预后较差组(术后3个月时血清总胆红素＞25μmol/L,自体肝存活时间＜1年),每组患儿标本各10例.将样本经iTRAQ标记和液相色谱分离后,用质谱仪进行鉴定和相对定量分析,对获得的差异蛋白进行PANTHER分类和生物功能分析,并对差异表达的蛋白Mx1进行了Western-blot验证.结果 经质谱鉴定共获得蛋白5 177个,其中差异表达倍数大于1.5倍的蛋白共323种,包括在预后较好组上调的蛋白131种和在预后较差组上调的蛋白192种.经PANTHER蛋白分类和功能分析,差异表达的蛋白主要涉及代谢过程、免疫过程等14个生物过程.其中在预后较好组差异表达倍数前10位的上调蛋白,几乎全部参与了病毒感染后的免疫应答过程.结论 iTRAQ技术能够快速、有效地进行肝脏差异蛋白质组学的研究,能筛选出多种与胆道闭锁病因和预后相关的蛋白,为进一步研究胆道闭锁发病机制提供了实验依据。