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拟南芥是研究植物基因功能的工具材料，在图旺克隆进行基因定位时面对数千个分子标记常常让新的研究者无从下手。【方法】本文通过从先前筛选的44个分子标记，进一步筛选出了24个平均分市于拟南茸五条染色津上的遗传标记。【结果】这24个标记在PCR检测中易于扩增、实验条件相差小、电泳条带区分度好，是进行图旺克隆的理想分子标记。【结论】利用这些标记，建立了拟南芥初定位快速图旺克隆系统，大大提高了初定位的效率，并实现拟南芥盐敏感突变体S28的快速染色体初定位。