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2007年4月1日全国结核病耐药性基线调查正式启动后，卫生部于2007年4月9日-15日、6月4日-10日先后两次组织了基线调查的专项督导，通过专项督导了解了各省（自治区、直辖市）临床病例纳人和实验室工作的进展情况。为了解工作情况，基线调查办公室建立了专门用于此次基线调查的月报制度，通过月报制度定期了解各个调查点的进展情况，包括初、复治病例的纳入进度，纳入的初、复治病例的培养结果，仪器设备的运行情况、试剂耗材的使用情况等等。