【摘 要】
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豫西黑猪作为一个极具发展潜力的地方品种,其种质资源面临着基因混杂的风险.通过对豫西黑猪的线粒体COXI基因进行PCR扩增、测序,并与其他22种不同猪种的COXI基因进行序列比对
【机 构】
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河南科技大学动物科技学院,河南洛阳 471023洛阳市动物遗传育种重点实验室;
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豫西黑猪作为一个极具发展潜力的地方品种,其种质资源面临着基因混杂的风险.通过对豫西黑猪的线粒体COXI基因进行PCR扩增、测序,并与其他22种不同猪种的COXI基因进行序列比对,采用最大似然法(ML法)和邻接法(NJ法)建立系统发育树,探究其与其他猪种之间的遗传变异及种系发育关系.结果表明,23个猪种该基因序列保守位点和变异位点分别占总位点的96.5％和3.5％,不同猪种间线粒体COXI基因的相似度均在96.5％以上.豫西黑猪线粒体COXI基因表现出明显A、T碱基偏好性.系统发育树和遗传距离结果显示,豫西黑猪种内遗传距离较近,并且与杜洛克猪的遗传距离较近,说明豫西黑猪与杜洛克猪之间存在基因混杂情况.
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