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系统生物学作为一个新兴的交叉学科,提出了生物学的一种新解释模式,仍称之为机械论解释。系统生物学的机械论解释与传统的机械论解释却不尽相同,具有自己的新内涵,既自下而上,从部分的行为建构动力学模型,又自上而下,通过控制论建模研究整体功能行为。本文力图对系统生物学的机械论解释进行分析,并提出用复杂适应系统的突现机制完善系统生物学的解释进路。