【摘 要】
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为探索钴型腈水合酶降解腈的微观降解机制,用分子对接的方法模拟了钴型腈水合酶与腈的相互作用,得到他们复合物结构的理论模型,根据打分函数最低原则筛选出的PtNHase与烟腈之
【机 构】
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陕西中医药大学、陕西省中药资源产业化协同创新中心,湖南大学环境科学与工程学院
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(51679085);陕西中医药大学校内基金项目(2015PY10)
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为探索钴型腈水合酶降解腈的微观降解机制,用分子对接的方法模拟了钴型腈水合酶与腈的相互作用,得到他们复合物结构的理论模型,根据打分函数最低原则筛选出的PtNHase与烟腈之间最佳构象打分函数为-63.9557,二次打分函数为-56.056。应用LPC/CSU server研究最佳构象的相互作用情况,结果表明,PtNHase与烟腈之间以疏水作用数量最多,钴型腈水合酶的氨基酸残基αLeu88、βAla122、βLeu127、βPhe37、βPhe41和βPhe118在催化过程中起到了关键作用。
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