目的 了解北京市甲型H1N1流行性感冒(简称流感)轻症与重症患者流感病毒的全基因组特性.方法 选取北京市甲型H1N1流感检测网络实验室于2009年6-12月在北京市定点医院采集的流感病例咽拭子标本作为研究对象,共21份,包括重症病例标本10份(其中有4份标本来源于死亡病例),轻症病例标本11份.由咽拭子标本中提取病毒核酸,设计基因组全长扩增引物,病毒核酸逆转录后进行PCR,对PCR产物测序,通过序列分析软件,分析病毒各基因进化和氨基酸变异情况.结果 2009年北京市流行的甲型H1N1流感病毒8个基因节段与疫苗株A/California/07/2009(H1N1)相比,核苷酸同源性高达99％以上,未发生较大变异,其中,血凝素蛋白(HA)、神经氨酸酶(NA)、核蛋白(NP)基因的遗传距离相对较长,分别为0.0050,0.0040,0.0040; HA基因的P83S、I321V,NA基因的N248D,多聚酶(PA)基因的P224S,NP基因的V100I、L122Q变异在所有样本中均发生.重症病例的HA、NA、NP、PA、多聚酶(PB2)、非结构蛋白(NS)基因具有明显基因进化聚集性；HA基因的S128P和S203T、PA基因的R269K和D547E、PB2基因的T588I、NS基因的I123V变异主要发生在重症病例中,分别有6、9、6、7、9、6例；其中HA基因的S203T、PA基因的R269K及D547E变异与重症病例的相关性具有统计学意义(P＜0.05).HA基冈变异主要分布在Ca与Cb抗原决定簇上,NA基因上无耐药突变,膜蛋白(M2)基因均发生耐药性突变,其余毒力相关基因未见突变.结论 2009年北京市甲型H1N1流感病毒与疫苗株A/California/07/2009(H1N1)同源性较高,发现与重症及死亡病例相关的突变位点,未发现毒力基因突变。
2009年北京市甲型H1N1流行性感冒轻重症患者病毒全基因组特性分析
【摘 要】
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目的 了解北京市甲型H1N1流行性感冒(简称流感)轻症与重症患者流感病毒的全基因组特性.方法 选取北京市甲型H1N1流感检测网络实验室于2009年6-12月在北京市定点医院采集的流感病例咽拭子标本作为研究对象,共21份,包括重症病例标本10份(其中有4份标本来源于死亡病例),轻症病例标本11份.由咽拭子标本中提取病毒核酸,设计基因组全长扩增引物,病毒核酸逆转录后进行PCR,对PCR产物测序,通过序
【机 构】
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100013北京市疾病预防控制中心传染病地方病控制所,100013北京市疾病预防控制中心传染病地方病控制所,100013北京市疾病预防控制中心传染病地方病控制所,100013北京市疾病预防控制中心传染
【出 处】
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中华预防医学杂志
【发表日期】
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2013年47期
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