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目的评价GeneXpert MTB/RIF(简称"GeneXpert")在涂阴疑似肺结核及利福平耐药快速检测中的临床应用价值。方法查阅2018年龙岩市各县区结核病定点医院及市疾病预防控制中心(简称"CDC")实验室检测结果登记本[包括痰涂片镜检、痰结核分枝杆菌固体培养、GeneXpert系统检测,以及比例法药物敏感性试验(简称"药敏试验")和菌种鉴定检测结果],并与《结核病管理信息系统》中患者实验室相关信息进行比对后,排除结果不一致及肺外结核的患者,共收集659例涂阴疑似肺结核患者实验室信息,其中307例行GeneXpert检测,519例行固体痰培养及菌种鉴定,228例同时行GeneXpert检测和固体痰培养检测,最终622例经临床综合诊断为涂阴肺结核。以临床诊断和痰培养为标准分别评价GeneXpert检测MTB的敏感度、特异度、一致性。另纳入97例同时开展GeneXpert与比例法药敏试验的肺结核患者,评价GeneXpert检测利福平耐药的效能。采用SPSS 24.0软件对数据进行统计学处理,不同方法结核分枝杆菌检出率的比较采用χ~2检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果在622例最终诊断为涂阴肺结核患者中,GeneXpert对MTB的阳性检出率(29.97%,92/307)明显高于痰培养的检出率(7.13%,37/519)(χ~2=76.30,P<0.05);以临床诊断为标准,GeneXpert检测MTB的特异度(100.00%,14/14)与痰培养(100.00%,23/23)一致,敏感度(31.40%,92/293)高于痰培养(7.46%,37/496),两种方法的检测结果与临床诊断结果的一致性均较差(Kappa=0.037,0.007)。以痰培养为金标准,GeneXpert检出MTB的敏感度(90.32%,28/31)与阴性预测值(98.09%,154/157)均较高,但特异度(77.00%,154/200)与阳性预测值(37.84%,28/74)较低,两种方法的检测结果呈中度一致(Kappa=0.420)。97例同时开展GeneXpert与比例法药敏试验检测的患者中,GeneXpert检出利福平耐药率(9.28%,7/97)与比例法药敏试验(6.18%,6/97)差异无统计学意义(χ~2=0.00,P>0.05)。结论 GeneXpert检测对涂阴疑似肺结核患者及利福平耐药均具有较高的检出率和敏感度,可推荐作为基层结核病定点医院临床快速确诊涂阴疑似肺结核及利福平耐药肺结核的检测手段。