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在高校校院两级管理体制改革的背景下,地方医学院校教学档案管理模式需要进行相应调整。从地方医学院校教学档案管理的实际出发,对存在的问题进行分析,提出构建校院两个级别,涵盖综合档案室、相关职能部门、学院、教研室四个层次的管理模式。对校院两级管理模式的组织架构进行梳理,并对其实施运行提出对策与建议。