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科技创新型企业投资效率的研究对于提高宏观投资效率、扩大有效投资、促进科技创新和经济高质量发展具有重要意义。本文采用DEA-Malmqusit模型评估了我国创业板科技创新型企业在2015-2018年期间投资效率及其分解项的动态变化情况，结果表明：近几年我国科技创新型企业投资效率不断提高，这主要得益于企业创新能力的提升，且企业创新能力的提升远远大于企业间的技术外溢效应。为进一步提高科技创新型企业投资效率，建议通过培育发展科技创新市场补齐短板，着力提高企业间技术外溢效应，形成“创新”和“外溢”两条腿走路、交相支撑的健康发展局面。