【摘 要】
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目的了解钦州市钦南区HIV-1流行亚型及gag基因变异特征。方法在钦南区采集97名未抗病毒治疗HIV-1感染者的血液样本,从血浆中提取病毒RNA,从单个核细胞中提取前病毒DNA,采用PC
【机 构】
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钦州市钦南区疾病预防控制中心,广西中医药大学附属瑞康医院,
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目的了解钦州市钦南区HIV-1流行亚型及gag基因变异特征。方法在钦南区采集97名未抗病毒治疗HIV-1感染者的血液样本,从血浆中提取病毒RNA,从单个核细胞中提取前病毒DNA,采用PCR技术对HIV-1 gag基因片段进行扩增并测序。使用MAGA5.03软件对所得序列进行系统进化树分析,并计算gag区及各编码区段的基因离散率。结果获得72份样本gag基因序列,其中CRF01_AE重组型占72.3%(52/72),CRF07_BC重组型占13.9%(10/72),CRF08_BC重组型占12.5%(9/72),G亚型占1.39%(1/72)。CRF01_AE、CRF07_BC和CRF08_BC的gag基因离散率分别为0.049±0.004、0.053±0.005和0.059±0.005,差异具有统计学意义(P<0.01)。结论钦南区HIV-1主要流行亚型是CRF01_AE,CRF 08_BC亚型离散率大于CRF 01_AE亚型和CRF 07_BC亚型。
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