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目前应用于净化养殖水体的微生态制剂主要有光合细菌、硝化细菌、芽孢杆菌、蛭弧菌、以及复合微生态制剂等。应用于生产的水质微生态制剂一方面对水体无毒副作用、可以改善水体生态环境,有广阔的应用前景;另一方面水质微生态制剂也存在亟待解决的问题:活菌浓度易受外界环境的影响、易被抗生素杀灭而使应用受到限制等等。但随着科学技术的不断发展将会逐渐克服这些问题,使水质微生态制剂的应用越来越广泛。