兔衣原体病与球虫病都是家兔常见病，在临床症状、病理变化上有相似之处。
　　1 衣原体病
　　病兔临床上以肠炎、肺炎和流产为特征。衣原体是介于立克氏体和病毒之间的病原微生物，致病性很强，能在100种以上的禽类和哺乳动物中查到本病原体。衣原体可引起肺炎、肠炎、流产、关节炎和结膜炎。本病主要通过被畜禽分泌物、血液、粪尿污染的尘土和飞沫经呼吸道和消化道感染。
　　病兔胃、十二指肠和空肠充满液体，结肠内有大量清稀或粘液样物质，肠系膜淋巴结肿大，脾脏肿大，肺炎，肺有坏死病灶，呈现败血症变化。
　　加强对兔的饲养管理，提高机体的抵抗力。做好卫生工作，及时清除兔舍内的粪便，做到定期消毒。从外地引进种兔时要进行隔离检疫，确定无病后才能混群饲养。当有本病发生时，对病兔进行隔离治疗。对被污染的用具、兔笼、场地进行消毒，尸体应深埋处理。人也能感染衣原体，所以在与病兔接触和处理病死兔时应注意防范。本病经呼吸道、消化道及胎盘感染，虱子、跳蚤、螨和蜱及蚊蝇等为传播媒介。因此，应防范和消灭这些害虫。
　　治疗可口服土霉素，每只兔每次口服100～200毫克，每天两次，连用3～4天。土霉素肌内注射，每千克体重40毫克，用注射5%葡萄糖生理盐水溶解，每天两次，连用3～4天，也可在每千克饲料中加入土霉素0.2～0.4毫克，混合均匀饲喂。红霉素肌内注射，每千克体重20～40毫克，每天两次，连用3～4天。金霉素肌内注射，每千克体重40毫克，每天两次，连用2～3天。对发生眼疾和流产的病兔采取对症治疗。
　　2 球虫病
　　球虫病是多种球虫寄生于肠和胆管上皮细胞内而引起的，是家兔最常见且危害极为严重的寄生虫病。临床上根据发病的速度又分为急性、亚急性和慢性。急性的表现为突然死亡，类似于兔病毒性出血症。慢性的则表现为反复顽固性腹泻，日渐消瘦，精神、食欲差，最后继发感染、衰竭而死亡。病兔和带虫病兔粪便中的卵囊是本病的传染源。
　　病兔特征病变在肠道，尤其是小肠，炎症特别明显，肠壁变薄，外观呈粉红色，常见可臌气，严重的整个小肠臌气，肠内容物呈粘糊状或含有气体的稀糊状，甚至含有多量红色粘液，肠内壁充血，有的甚至有渗出性出血，黏膜容易脱落，盲肠臌气，浆膜出血或水肿；有的病兔肺有轻度水肿、充血，甚至出血，但不太严重，其余器官病变不明显。尸体消瘦，被毛粗乱，可视黏膜苍白或呈黄色，肛门周围被粪便污染。
　　球虫病的预防显得尤为重要，潮湿、温暖的环境最适宜于球虫卵囊孵化，温度以20～30℃时最适宜，特别是梅雨季节更应重视。从断奶至75日龄的兔子最易感，这一年龄段都应在饲料中添加预防性抗球虫药。勤消毒，兔笼壁用火焰消毒最彻底。地面用“百毒杀等”（主要成分为癸甲溴铵）消毒较好，垫板最简单易行的消毒方法是先在水池中浸泡，浸泡液中可加入3%来苏儿或漂白粉，然后用刷子刷洗，再在太阳底下曝晒。选好药，首先要选质量可靠，产生耐药性较低的抗球虫药。如主要成分为地克珠利一类的产生抗药性较低的球虫药，而磺胺类药作为预防用一般不可取。一般情况下一种抗球虫药使用不宜超过半年就应更换。但由于当今抗球虫的新药较少，生产上仍然得沿用地克珠利、氯苯胍等进行交替使用。
　　一般磺胺类药治效果较好，用磺胺喹恶啉加增效磺胺，每50千克饲料拌50克药，连用五天，一般一个疗程即可得到控制，严重的可停药间隔2～3天后再增加一个疗程。同时增加一些防止继发细菌感染的药物，如环丙沙星之类的抗生素，疗效更佳。再者发病期间少喂精料，适当增加青绿饲料的喂量，减少肠胃负担，提高肠道的生态功能，也有利于虫球病的康复。
　　3 鉴别诊断
　　衣原体病。病兔临床症状为消瘦、水泻，迅速死亡。妊娠母兔发生流产，并能引起肺炎。兔胃、十二指肠和空肠充满液体，结肠内有大量清稀液体，肠系膜淋巴结肿大，肝无坏死病灶，而肺臟有坏死病灶。
　　球虫病。眼球发紫，结膜苍白、贫血，出现黄疸，腹部膨胀呈青紫色，急性型突然四肢痉挛。死亡兔血液稀薄，凝固不良。十二指肠、回肠、盲肠黏膜充血，肠管扩张，蚓突、圆小囊、肝脏有灰白色坏死病灶，这种病灶与沙门氏菌病不同的是没有麸皮状物覆盖。