【摘 要】
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目的:以丹参基因组及全长转录组数据库为基础,对丹参酮生物合成关键酶基因进行预测,进一步推进丹参酮生物合成途径的解析。方法:结合丹参中CYP450s的系统发育鉴定丹参CYP71cl
【机 构】
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吉林农业大学食品科学与工程学院,中国医学科学院/北京协和医学院药用植物研究所中药资源教育部工程研究中心,国家中医药管理局中药资源保护重点研究室
【基金项目】
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国家自然科学基金青年基金项目(31700264)：丹参酮生物合成关键酶短链脱氢酶编码基因的克隆和功能鉴定，负责人：徐志超
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目的:以丹参基因组及全长转录组数据库为基础,对丹参酮生物合成关键酶基因进行预测,进一步推进丹参酮生物合成途径的解析。方法:结合丹参中CYP450s的系统发育鉴定丹参CYP71clan成员,采用生物信息技术分析其差异表达、基因结构和保守基序等;克隆候选基因并进行理化特性和蛋白结构等分析。结果:从丹参基因组注释到161个CYP71clan成员,分为16个家族,其中CYP71家族成员有64个,数量最多且结构域保守。转录组表达分析显示CYP71clan中36%的基因高表达(FPKM> 10)。克隆到基因Sm
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