多重Taqman探针实时RT-PCR检测手足口病病原体方法的建立及临床应用

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目的

建立多重Taqman探针实时RT-PCR法同步检测肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A16型(CA16)和包括EV71、CA16的肠道病毒通用型(EV)。

方法

回顾性研究。根据EV71、CA16和EV的保守序列,设计并合成相应的引物和探针,对该体系进行灵敏度、特异性和重复性验证。收集2012年4至7月南京医科大学附属南京儿童医院收治的176例疑似手足口病患儿咽拭子标本作为实验组,另收集10名在此期间到我院体检的健康儿童、10例门诊流感样患儿和90例我院呼吸科收治的呼吸系统疾病患儿咽拭子标本作为对照组。应用该方法对以上286份标本进行EV71/CA16/EV的同步检测。应用SPSS 13.0统计软件进行统计分析。

结果

该方法EV71、CA16和EV 3个通道的检测限均为1.0×103拷贝/ml;对9株肠道病毒和3株非肠道病毒毒株核酸的检测结果均正确,特异度100%;对1.0×103拷贝/ml、1.0×104拷贝/ml、1.0×105拷贝/ml的重组质粒进行重复性实验,其变异系数分别为0.44%~1.04%,0.38%~0.73%,0.46%~0.90%;运用多重Taqman探针实时RT-PCR法与实时RT-PCR法对176例疑似手足口病患儿临床标本进行检测和结果比对,两种方法的一致性为97.2%(171/176),Kappa=0.94。

结论

建立了同步检测EV71/CA16/EV的多重Taqman探针实时RT-PCR法,该方法灵敏度高,特异性好,可为临床快速诊断EV71、CA16和EV感染提供依据,有较强的临床及科研应用前景。(中华检验医学杂志,2013,36:845-849)

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