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在国际前沿技术EFS(evolutionary fuzzing system)的研究基础上,提出基于控制流序位比对算法的智能Fuzzing测试方法。根据遗传算法的内在属性演算得到基于序列比对的适应度函数,并有效地计算出需要搜索的程序逻辑空间。最后给出了该方法与2种传统Fuzzing方法的测试性能的实验结果比对,证明了该方法能够充分利用遗传算法属性中并行性进行智能地程序逻辑学习,具有逻辑覆盖面广、搜索导向性强的优点,能够提高漏洞挖掘能力。