目的利用基因芯片技术筛选不同剂量活血中药（川芎、当归）、破血中药（三棱、莪术）对载脂蛋白E（ApoE）基因敲除小鼠动脉粥样硬化（AS）模型胸主动脉组织中差异表达的基因,研究其表达情况并探讨其作用机制。方法以同品系C57BL/6小鼠6只作为空白对照组。将64只5周龄ApoE基因缺陷小鼠按随机数字表法分为模型对照组（n=10）、阿托伐他汀钙组（n=10）、低活血药组（n=11）、低破血药组（n=11）、高活血药组（n=11）、高破血药组（n=11）,每日均予普通饲料喂养复制AS模型。造模成功后,空白组和模型组灌服等体积蒸馏水,各组给药剂量分别为:他汀组2.6 mg·kg^-1·d^-1（相当于阿托伐他汀钙成人日用药量20 mg）;低活血组2.6 g·kg^-1·d^-1（相当于当归、川芎成人日用药量各10 g）;低破血组2.6 g·kg^-1·d^-1（相当于三棱、莪术成人日用药量各10 g）;高活血组10.4 g·kg^-1·d^-1（相当于当归、川芎成人日用药量各40 g）;高破血组10.4 g·kg^-1·d^-1（相当于三棱、莪术成人日用药量各40 g）,连续8周,处理动物,用基因芯片技术检测小鼠胸主动脉组织中差异表达的基因。结果空白组与模型组比较,有154个差异表达基因,其中90个基因上调,64个基因下调;模型组与他汀组比较,有96个差异表达基因,其中有17个基因上调,79个基因下调;模型组与低活组比较,有214个差异表达基因,其中95个基因上调,119个基因下调;模型组与低破组比较,有134个差异表达基因,其中87个基因上调,47个基因下调;高活组与低活组比较,有236个差异表达基因,其中169个基因上调,67个基因下调;高破组与低破组比较,有184个差异表达基因,其中88个基因上调,96个基因下调。与AS相关的基因有:与模型组比较,活血药组、破血药组中Cxcr4、Alox12、MoxSap、VcamI的表达下调,Ccr5、Cxcl12、Cxcl16、LCAT的表达上调。结论活血中药（当归、川芎）、破血中药（三棱、莪术）具有抗动脉粥样硬化的作用,其作用机制可能与多种基因表达水平的改变有关。