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僵藕的部分表皮细胞已破坏或凹陷,表皮层上有入侵的真菌,表皮层之下为一层单宁细胞,其中有些已破坏或破裂,在基本组织中有多个由于薄壁细胞分解而形成的空腔。其薄壁细胞体积校正常藕者为小,且内含的蛋白质及淀粉粒很少。气道周围的细胞分裂已停止,没有草酸钙结晶存在,维管束减退甚至一个堆管束中部分或所有的管胞分子均已破坏,留下一个未质部空腔和韧皮部。