为研究猪瘟病毒（CSFV）2.1d新基因亚型的基因组特征,本研究根据Gen Bank中登录的Zj0801株CSFV全基因组序列设计合成6对引物,通过RT-PCR方法对2014年分离自山东的两株2.1d亚型CSFV（SDSG1410和SDLS1410）进行全基因组测序,两株CSFV全长均为12 296 nt。全基因组遗传演化分析表明这两个分离株位于一个独立分支中,属于2.1d亚型,与E2基因分型结果一致。核苷酸和推导氨基酸同源性分析显示,分离株全基因组同源性与参考株相比差异较大,与Zj0801株的全基因组同源性最高为97.3%⁹7.5%,而与1.1亚型的Shimen和HCLV株的同源性仅为85.0%⁸5.1%和84.3%⁸4.4%;部分基因和非翻译区变异较大,如N^pro、C、E2、NS2、NS5A和3’UTR。对全基因组氨基酸序列分析,结果显示2.1d亚型CSFV在V⁶⁴⁰、K⁹⁹²、A¹⁰²⁰、M¹⁰⁹⁰、R¹³⁹⁵和D²³⁷⁴ 6处氨基酸上具有共同的分子特征。以上研究结果增加了CSFV 2.1d新基因亚型的分型依据。