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松溪白马山省级自然保护区有维管植物152科895种,分别占福建省科、种数的65.8%和23.99%,其中蕨类植物26科74种,裸子植物6科12种,被子植物120科809种。科的地理成分主要是泛热带分布型。泛热带分布36.51%,北温带和南温带间断分布9.52%,东亚(热带、亚热带)及热带南美间断分布7.15%。说明本区系起源古老,特有种多。