以中国产熊野藻属Kumanoa 的两个种,绞扭熊野藻K.intorta(=绞扭串珠藻Batrachospermum intortum),弯形熊野藻K.curvata(=弯形串珠藻B.curvatum)和其它6种淡水红藻为实验材料,对其psaA 和psbA 基因进行扩增和测序,并与GenBank 中相近序列进行比对分析,以贝叶斯法、最大似然法和邻接法分别构建了单基因和联合基因系统发育树.结果表明,3 种方法构建的系统树具有相似的拓扑结构,反映的系统发育关系基本一致,熊野藻属中的两个种聚为一支,与串珠藻属相分离,支持该属的建立；中国产的熊野藻属分子学研究结果与来自南美洲及澳洲的该属植物结果一致,说明该属的建立具有广泛的地理适用性.系统发育树聚类结果也明确反映了熊野藻属与串珠藻属较近的亲缘关系,根据果胞枝形态特点,推测熊野藻属进化地位晚于串珠藻属植物,而早于顶丝藻目和红索藻目.此外,胶串珠藻与其它串珠藻组植物分离,支持将其单独分组,红索藻目植物与串珠藻目植物分离,支持红索藻目的建立.同时也表明psaA 和psbA 基因用于淡水红藻分析,能够较好地反映其系统发育关系.