7型腺病毒疫苗株DNA左侧17.5mu片段克隆及4.8mu片段核苷酸序列分析

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:guogangw1987
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目的获得7型腺病毒疫苗株DNA左侧0~175mu片段克隆,分析0~48mu片段(末端倒置重复序列、包装信号位点和Ela区)核苷酸序列。方法从Ad7疫苗株感染的A549细胞提取Ad7DNA,将其03~175mu片段克隆到质粒pAd7T,并用自动和银染方法测序。结果获得了Ad7疫苗株左侧175mu片段克隆,测定了左侧1737bp核苷酸序列,其中Ela区所编码的6300、24000、28000等3个蛋白的DNA序列,与Gomen株的同源性分别为989%、973%和975%,推导编码氨基酸的同源性分别为966%、965%和969%。这3个蛋白与Grider株的同源性分别为100%、997%、和997%;推导编码氨基酸的同源性分别为100%、991%和992%。结论Ad7疫苗株左侧1738bp核苷酸与Ad7Gomen株和Grider株相应片段,具有高度的同源性。 OBJECTIVE: To obtain the 0 ~ 175 mu fragment on the left side of the DNA of type 7 adenovirus vaccine and to analyze the nucleotide sequence of 0 ~ 48 mu fragment (terminal inverted repeat, packaging signal site and Ela region). Methods Ad7 DNA was extracted from A549 cells infected with Ad7 vaccine strain, and the 03 ~ 175 mu fragment was cloned into plasmid pAd7T and sequenced automatically by silver staining. Results A 175mu fragment was cloned on the left side of the Ad7 vaccine strain. The 1737bp nucleotide sequence of the left side of the Ad7 vaccine strain was obtained. The DNA sequence of the 6300, 24000, 28000 and so on encoded by the Ela region was homologous with that of the Gomen strain 989%, 973% and 975%, respectively. The deduced amino acids homologies were 966%, 965% and 969%, respectively. The homologies of these three proteins to Grider strains were 100%, 99.7%, and 99.7%, respectively. The deduced amino acid identities were 100%, 991% and 992%, respectively. Conclusion The 1738bp nucleotide on the left of Ad7 vaccine strain has high homology with the corresponding fragments of Ad7Gomen strain and Grider strain.
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