目的 分析HBV反转录酶区(RT)rtM204位点Y(I/V)DD变异与前C及C基因启动子(PC-BCP)变异关系. 方法 应用MEGA4对来自GenBank/EMBL/DDBJ的人类2 849株HBV全基因序列序列重新排列,分析Y(I/V)DD变异与PC-BCP变异及模式相关性. 结果 rtM204(I/V)DD变异株217株(8.0％); PC-BCP变异株1 543株(54.2％),有(1)G1896A、(2)G 1899A、(3) G1896A+G1899A、(4) A1762T/G1764A、(5) A1762T/G1764A+G1896A、(6)A 1762T/G 1764A+G1899A、(7) A1762T/G1764A+G1896A+G1899A 7种变异模式; Y(I/V)DD与PC-BCP联合变异165株.YMDD与PC-BCP双变异率高于单纯YMDD变异率(76％比24.0％,x2=45.283,P=0.000);YIDD与PC-BCP双变异率高于YVDD与PC-BCP双变异率(85％比64.9％,x2=11.836,P=0.000)及使用LAM致YMDD与PC-BCP双变异率高于未使用LAM预存YMDD与PC-BCP双变异率(89.3％比58.9％,x2=27.084,P=0.000).二分类logistic回归分析仅对YIDD有影响而对YVDD无影响的PC-BCP变异模式有G1896A-G1899A(P=0.000,OR=7.573)、A1762T/G1764A-G1899A(P=0.000,OR=6.539)和A1762T/G 1764A-G 1896A-G1899A(P=0.000,OR=6.596). 结论 YMDD变异与PC-BCP变异相关;PC-BCP变异模式的差异与YI/VDD变异选择强度有一定的关系。
乙型肝炎病毒Y(I/V)DD变异与前C及C基因启动子变异生物信息研究
【摘 要】
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目的 分析HBV反转录酶区(RT)rtM204位点Y(I/V)DD变异与前C及C基因启动子(PC-BCP)变异关系. 方法 应用MEGA4对来自GenBank/EMBL/DDBJ的人类2 849株HBV全基因序列序列重新排列,分析Y(I/V)DD变异与PC-BCP变异及模式相关性. 结果 rtM204(I/V)DD变异株217株(8.0％); PC-BCP变异株1 543株(54.2％),有(1)
【机 构】
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200083上海(复旦大学附属)公共卫生临床中心肝病中心,200083上海(复旦大学附属)公共卫生临床中心肝病中心,南方医科大学南方医院感染科,南方医科大学南方医院感染科,南方医科大学南方医院感染科,
【出 处】
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中华肝脏病杂志
【发表日期】
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2014年22期
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