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内含子ncRNA是非编码RNA的组成部分，它们在基因的转录调控和转录后调控中发挥着十分重要的作用。大多数内含子ncRNA随宿主基因一起转录，而部分内含子ncRNA存在独立转录的特性。由于这种独立转录特性会对相关基因和通路产生重要的影响，因此分析内含子ncRNA独立转录调控机制对研究基因调控系统就有着重要的意义。本文综述了近几年寻找独立转录位点的一些方法、研究内含子ncRNA独立转录的现状以及与其宿主基因的相互作用关系。