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日本现代医药制度建立始于明冶维新之后。1872年文部省设立医务课，1875年归内务省，设立卫生局。1897年以后40年间，陆续制定了《传染病预防法》等9部立法。1937年制定《保健所法》，成立49个保健所。次年正式成立厚生省。由于侵略战争，战后传染病流行，医药粮食极度缺乏。1946年随着新宪法制定，《食品卫生法》等一系列卫生法规推进了日本的卫生改革。随着日本经济腾飞，尤其是1964年东京奥运会后，日本国民健康水平达到较高的水平，卫生事业的重点已经从传染病转移到更新的领域。