我国云南部分HIV-1感染者黏合素蛋白基因单核苷酸多态性研究

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目的 分析我国云南地区部分HIV-1感染者体内黏合素蛋白基因单核苷酸多态性,为了解我国人群HIV感染与病程进展相关的遗传因素提供基础数据.方法 在云南省收集HIV-1感染者静脉血,分离外周血淋巴细胞,提取基因组DNA,PCR扩增目的基因后行Sanger测序,BioEdit软件分析序列以确定多态性位点的存在情况,Haploview v4.2软件确定多态性位点连锁情况.结果 获得了来自18个民族的HIV-1感染者体内黏合素蛋白基因序列95条,检出多态性位点19个,频率>5%的位点13个,其中外显子区域6个、内含子区域4个、非翻译区3个;连锁不平衡分析显示符合Hardy-Weinberg平衡分布,g.2170、g.2305、g.2504和g.2770间任意两位点呈高度连锁,g.2305、g.2504、g.2736和g.2770间任意两位点呈高度连锁(r2≥0.8).统计学分析显示,上述多态性位点与民族、传播途径、CD4细胞计数及病毒载量间无显著相关性.结论 首次获得中国人群黏合素蛋白基因多态性数据,为进一步分析其与HIV-1感染及进程的关系奠定了基础.
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