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目的 揭示北京地区啮齿类动物所携带的流行性出血热(EHF)汉坦病毒的基因型、毒株差异,追溯其传染来源.方法 本研究应用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增技术及核苷酸序列测定方法对免疫荧光抗原阳性的标本进行研究分析.结果 对5个阳性标本的300 bp部分M基因组片段序列分析表明均为SEO型汉坦病毒;毒株核苷酸序列比较表明:与其他SEO型毒株同源性均达94%以上,而与其他HNT型毒株同源性均低于72%;毒株序列所构建的系统发生树显示,北京地区SEO型汉坦病毒可能至少存在4个不同的进化分支和两个不同的汉坦病毒亚型.结论 北京地区流行性出血热流行的主要毒株是SEO型汉坦病毒,毒株间存在着一定的基因差异,其传染来源有待深入研究.