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从新开发的百合 EST-SSR 标记引物中筛选了 19 对多态性较高的引物,对百合 22 个原生种和 74 个品种进行了标记分析,依据各样品间的 Jaccard’s遗传距离,用 MEGA 5.05 构建系统树,并用主坐标分析对试验样品进行类群划分。系统树显示:原产中国的原生种首先分化为两个类群:类群Ⅰ包括卷丹(Lilium lancifolium)、渥丹(L. concolor)、毛百合(L. dauricum)、川百合(L. davidii)、大花卷丹(L.leichtlinii var. maximowiczii)、大花百合(L. concolor var. megalanthum)、淡黄花百合(L. sulphureum)、山丹(L. pumilum)、百合(L. brownii var. viridulum)、兰州百合(L. davidi var. unicdor)等,其中一些为亚洲百合杂种系的起源亲本及麝香百合杂种系的亲本,推测由这些种杂交衍生出亚洲百合杂种系、麝香百合杂种系及 LA 系;类群Ⅱ包括宜昌百合(L. leucanthum)、湖北百合(L. henryi)、岷江百合(L. regale)等喇叭百合杂种系及东方百合杂种系的亲本,分别衍生出喇叭百合杂种系、东方百合杂种系及 OT 系,与已有文献记载基本相符。用 NTSYS-pc 2.11a 作主坐标分析,结果将供试材料分为亚洲百合杂种系、东方百合杂种系、OT 系、LA 系、原生种等类群,与已知分类关系基本相符。