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科技创新能力是区域经济增长最能动的因素，随着“泛珠三角”区域合作与东盟对接，泛珠三角科技合作渗入了国际科技合作因素，区域科技产品的市场扩展具有更广阔的空间，“泛珠”的经济科技合作重点也将随之出现一些变化。泛珠三角科技合作适应中国-东盟自由贸易区建设这一形势，宜采取产业互动演化科技合作模式和产品创新联合攻关模式，泛珠三角科技合作与产业结构升级的互动将使中国-东盟合作互补性增强，区内贸易增加，增加贸易创造效应，增强区域凝聚力。广东适度发展重化工业，提高技术密集产业比重,将改变目前中国与东盟均以劳动密集产业为主