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在“理想株型与优势利用相结合”育种理论指导下，亚种间杂交为中国北方粳型超级稻增产做出了巨大贡献。以中国北方栽培粳稻品种为试材，利用籼粳特异性标记Indel与SSILP分析了不同年代与地区北方粳稻品种的籼型血缘的相对含量．结果表明，20世纪90年代以后育成品种籼型基因型频率显著增加。相关分析表明，籼稻血缘含量与每穗粒数存在显著的正相关性，与有效穗数存在显著的负相关性。进一步对籼粳杂交育成品种的8个产量与品质相关基因进行检测发现，育种家通过“选择”将控制穗粒数与粒重的籼稻增产基因GNla、GS3部分固定于北方