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在各种生物信息学计算软件层出不穷的情况下，如何向生物科研人员提供方便实用的计算服务显得日益重要。本文以生物信息学计算为应用背景，提出了一种“Portal层-应用服务层-核心服务层-资源层”的四层体系结构，以Eclipse为主要开发工具，设计了一个基于Web服务的生物信息服务平台，并具体介绍了相应的实现机制。