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采用高效、环保的水解方法提取了鳕鱼皮中的胶原蛋白，并应用木瓜蛋白酶制取鱼皮胶原蛋白短肽，根据胶原蛋白的提取率确定了提取的最适反应条件，通过纸层析和SDS-PAGE电泳技术分析了鱼皮胶原蛋白的水解情况。结果表明，酶与原料比为1：300、酶反应时间10h、反应温度55℃、pH值为6．8，胶原蛋白的提取率最高；鱼皮胶原蛋白的水解产物主要以6～29ku的小分子质量的短肽形式存在。以废弃鳕鱼皮作实验材料，可减少环境污染，节约资源，提高水产品废弃物的附加值。