RIXI过量表达转基因水稻的全基因组表达谱分析

来源 :浙江大学学报:农业与生命科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qncypt
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为研究水稻植株中木聚糖酶抑制剂基因RIXI过量表达是否会引起其他基因的差异表达,利用转录组测序(RNA-Seq)技术结合数字基因表达谱分析对RIXI过量表达单拷贝纯合株系R7进行基因差异表达分析.水稻全基因表达谱显示,RIXI过表达引起水稻中大量基因的表达差异,包括391个上调基因,905个下调基因.GO 分析将差异基因分成30个功能聚类,其中的5组聚类中含有较多的差异基因,分别为单个有机体代谢过程、生物调控、阴离子结合、小分子结合和核苷酸结合.利用KEGG数据库,通过 Pathway显著性富集确定差异表
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