研究不同废水处理系统中微生物群落结构和群落结构之间的关系和系统处理效率，使用单链构象多态性（SSCP）分别脱氮和除磷反应器稳定运行的（N），中药废水处理反应堆（P），啤酒废水处理反应堆（W），糖蜜废水发酵制氢反应器（H）和硫酸盐还原反应器（S），和其他五种废水处理系统中微生物群落结构分析。结果表明，相同的污水处理和国家统一的反应堆的微生物群落结构相似性最大；微生物种群多样性和有机物质密切相关的废水的复杂性，传统的中药废水包含一个复杂的有机物质组成、物种多样性最高，和人工配水系统的处理，因为单一营养，低物种多样性；与之相比，微生物模型社区SSCP乐队，根据一定功能的微生物组在整个系统相对于数量不是主导，发酵制氢细菌Ethanologenbacteriumsp。完好的相对含量只有5%氢生产反应堆，和脱硫弧菌Desulfovibriosp。比率小于1.5%在硫酸盐还原反应器SSCP指纹技术可以揭示微生物群落结构的差异在不同的处理系统，以及这些功能的过程中微生物监测，并提供有益的指导，提高反应器运行效果。