川西獐牙菜SmDXS2基因的克隆及表达分析

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1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶(1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase,DXS)是2-C-甲基-D-赤藻糖醇-4-磷酸(MEP)途径的第一个关键酶。该研究根据川西獐牙菜Swertia mussotii转录组数据,克隆获得其DXS2基因(Gen Bank注册号MH535905),命名为Sm DXS2。生物信息学分析表明Sm DXS2基因无内含子,其开放阅读框全长2 145 bp,编码714个氨基酸,分别属于20种氨基酸,其中丙氨酸、甘氨酸和色氨酸含量最高;相对分子质量为76. 91 k Da,理论等电点为6. 50,属亲水性蛋白;二级结构中α-螺旋占36. 83%,延伸链占9. 38%,loop占53. 78%;序列内部无信号肽,没有跨膜区,为非分泌型蛋白;序列中含有TPP结合位点、嘧啶结合结构域和C端的转酮酶结构域;系统发育分析结果显示Sm DXS2与滇龙胆DXS2共聚于一个分支。Sm DXS2基因在大肠杆菌中表达的重组蛋白相对分子质量约为94 k Da,与预测蛋白大小一致。该研究为进一步探讨该基因的功能和利用基因工程手段提高川西獐牙菜中环烯醚萜类化合物产量提供了理论依据。
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