基于单细胞测序及蛋白质组数据分析尿酸转运蛋白在肾脏的精细表达定位

来源 :中华肾病研究电子杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lmwtz0x8u0

【摘要】

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目的利用单细胞测序、微量蛋白质组学及免疫组化三部分数据深入分析肾脏尿酸转运蛋白的细胞分布及表达丰度。方法利用2个成人健康肾脏的单细胞测序数据集(GSE131685)分析12个

【作者】

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陈小龙迟坤邓翼遥蔡广研陈香美洪权

【机构】

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解放军总医院第一医学中心肾脏病科、解放军肾脏病研究所、肾脏疾病国家重点实验室、国家慢性肾病临床医学研究中心、肾脏疾病研究北京市重点实验室

【出处】

：

中华肾病研究电子杂志

【发表日期】

：

2020年4期

【关键词】

：

单细胞测序激光微切割尿酸转运蛋白 Single-cell sequencingLaser capture microdissectionUric acid

【基金项目】

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国家自然科学基金面上项目(81870491),解放军总医院杰出青年人才培育计划(2019-JQPY-002),国家科技部研发计划政府间合作项目(2018YFE0126600)

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目的利用单细胞测序、微量蛋白质组学及免疫组化三部分数据深入分析肾脏尿酸转运蛋白的细胞分布及表达丰度。方法利用2个成人健康肾脏的单细胞测序数据集(GSE131685)分析12个肾脏尿酸转运基因的细胞定位及表达丰度,进一步利用激光微切割联合质谱检测大鼠肾小管14个区段蛋白质数据集12个蛋白的定位和丰度,最后利用ProteinAtlas数据库检索上述蛋白在肾脏中的免疫组化染色结果。结果单细胞测序数据集GSE131685中,12个尿酸转运蛋白集中表达于近端小管细胞,而在KIT数据集中,除了ABCG2、SLC22A

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