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鱼类的三毛金藻病一年四季均可发生,主要发生于初春、秋末和冬季低温季节。其他藻类因受低温的影响,繁殖缓慢,数量较小,而三毛金藻因耐低温而能形成优势种群、引起水体中的危害。夏季一般发生较少,因夏季水温较高,其他藻类种群能大量繁殖,从而抑制了三毛金藻的大量繁殖。但是当水质条件适合三毛金藻繁殖,特别是总氨含量低时,其他藻类形不成优势种群,