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非经营性国有资产是高校国有资产的重要组成部分，由于委托代理，既产生了高昂的代理成本，也直接影响到国有资产管理体制的效率。具体表现为：资产重置现象严重，且使用效率低下；配置给科研单位及研究人员的经费并未专款专用，甚至被中饱私囊；成本核算管理匮乏，经营亏损严重。基于此，必须加强法制建设，将高校非经营性国有资产的管理纳入法制化、规范化的轨道；深化改革，因地制宜，探索并构建符合高校自身实际的管理模式；奖罚分明，建立科学完善的非经营性国有资产绩效评价体系。