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国家性科研院所是日本船舶工业获得和保持技术竞争优势的重要依靠力量，如何对国家性科研院所进行管理对于提升其运行效率，增强基础性、共性技术的研究能力具有十分重要的意义.本文重点从宏观和微观两大层面介绍日本对国家性船舶科研院所（海上技术安全研究所）的体制和机制改革，包括中期目标制度和课题评价制度。在此基础上，结合我国船舶科研实际进行了分析。