目的研究中国南方汉族群体中,扩增产物片段长度在180bp以下的9个Y染色体的短串联重复(Y-shorttandemrepeat,Y-STR)基因座的遗传多态性,并用于法医学鉴定。方法采用PCR复合扩增和基因测序仪荧光检测方法,检测213个无关男性个体,调查南方汉族的9个Y-STR基因座的等位基因频率和单倍型频率,并对84对真父子和36对非父子的亲子鉴定样本进行检测。结果213个无关男性个体中,DYS426基因座检出3个等位基因,DYS393、DYS460、DYS391和DYS389Ⅰ基因座均检出了5个等位基因,DYS456基因座检出6个等位基因,H4和DYS388基因座检出7个等位基因,DYS458基因座检出8个等位基因。除DYS426基因座的基因多样性(genediversity,GD)值(0.1489)较低外,其余8个基因座的GD值介于0·5064~0.9133。9个Y-STR基因座的单倍型共有178种,其中154种单倍型仅出现1次,单倍型多样性达0·9983。在84对真父子中,未观察到基因座突变。检测36对非父子,有2个Y-STR基因座排除的案例有2例(5.56%);有3个和3个以上的Y-STR基因座可以排除父子关系的案例为33例(91.67%);9个Y-STR基因座不能排除父子关系的有1例。结论9个Y-STR基因座具有丰富的遗传多态性,该短片段长度Y-STR基因复合荧光扩增系统可用于法医学个体识别和亲子鉴定。