【摘 要】
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为解析发菜吸水和干燥条件下的基因差异表达规律以及发菜适应“干-湿”水分节律调控机制,该研究以充分吸水发菜藻体为对照组,干燥状态下的发菜藻体为处理组,采用高通量Illumina HiSeq PE150测序平台结合生物信息学分析方法对发菜吸水和干燥条件下的差异表达基因进行分析.结果显示:(1)发菜吸水和干燥条件下共鉴定到差异表达基因3383个,其中显著上调和显著下调表达的基因数分别为1767个和1616个.(2)GO功能富集分析发现,在吸水和干燥条件下发菜差异表达基因主要富集在蛋白质合成与代谢等相关途径中;K
【机 构】
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宁夏大学生命科学学院, 银川 750021
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为解析发菜吸水和干燥条件下的基因差异表达规律以及发菜适应“干-湿”水分节律调控机制,该研究以充分吸水发菜藻体为对照组,干燥状态下的发菜藻体为处理组,采用高通量Illumina HiSeq PE150测序平台结合生物信息学分析方法对发菜吸水和干燥条件下的差异表达基因进行分析.结果显示:(1)发菜吸水和干燥条件下共鉴定到差异表达基因3383个,其中显著上调和显著下调表达的基因数分别为1767个和1616个.(2)GO功能富集分析发现,在吸水和干燥条件下发菜差异表达基因主要富集在蛋白质合成与代谢等相关途径中;KEGG显著性富集分析发现,吸水和干燥条件下发菜有46个差异表达基因被显著富集到核糖体代谢途径,且均为显著上调表达,这些基因可能参与发菜对干旱胁迫的响应.(3)随机挑选6个被显著富集到核糖体代谢途径的基因进行qRT-PCR分析发现,其基因相对表达量与转录组测序结果一致.研究表明,发菜在干燥条件下可能通过激活核糖体代谢特定基因表达帮助抗旱相关的蛋白质的合成和正确折叠、并参与渗透调节等重要生理活动进而调控其适应干燥环境条件.
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该研究采用常规压片法对分布于内蒙古高原的6个沙鞭居群的染色体核型进行研究,探讨沙鞭不同居群的核型特征及其进化关系.结果表明:(1)沙鞭6个居群的染色体数目恒定,均为2n=2x=46.(2)染色体有正中部着丝粒(M)、中部着丝粒(m)、亚中部着丝粒(sm)和亚端部着丝粒(st)4种类型,且中部着丝粒类型数量最多.(3)沙鞭不同居群核型公式存在差异.(4)核型类型有1A、2A、1B和2B型4种,染色体平均臂比介于1.29~1.62,长度比为1.73~2.68.(5)核型不对称系数处于55.96% ~59.95
类根瘤菌26膜内在蛋白(nodulin 26-like intrinsic proteins,NIPs)是水通道蛋白的亚类,在植物营养获取和胁迫应答过程中发挥着重要作用.该研究利用多种生物信息学软件,对葡萄NIP家族基因进行分析,并采用RT-PCR方法克隆得到4个NIP家族基因,利用qRT-PCR方法分析非生物胁迫下NIP基因的表达特征.结果显示:(1)在葡萄基因组中,共鉴定到8个NIP基因,分布于葡萄4条染色体上,主要定位在质膜中;结构上含有6个跨膜结构域和两个典型的保守结构域NPA;氨基酸序列中存在很
针对安塞油田部分水源井无水停运问题,引入了“地下水资源富集程度”概念,并利用数值模型分析了安塞油田区域地下水资源富集程度和水源井停运原因,提出了水源井挖潜对象筛选原则.结果表明:研究区西北部主要河流河谷区的地下水资源富集程度较好,西部黄土丘陵地带以及东部河谷区地下水资源富集程度较差,东部黄土丘陵地带地下水资源富集程度差.水源井无水停运主要因为水源井布设在地下水资源富集程度较差区域.在挖潜对象筛选时应避开现状开采井过于集中、局部开采强度过大的区域(超采区),应分布在地下水富集区,并注意与现有正常运行的油田水
该研究以菊花彩瓣突变体CQ17-mu为材料,利用RT-PCR克隆获得了类黄酮-3\'-羟化酶基因(F3\'H),该基因开放阅读框全长1527 bp,编码508个氨基酸,与已知的菊花CmF3\'H相似性达到99%,故将其命名为CmF3\'Ha.氨基酸序列分析表明,CmF3\'Ha编码的蛋白具有保守的F3\'H结构域,属于P450超家族.多重序列比对和系统发育分析表明,CmF3\'Ha与其他菊花品种的F3\'H亲缘关系最近.实时定量PCR分析显示,CQ17-mu花瓣中CmF3
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