基于miRNA-靶位点配对的序列特征研究

来源 :分析测试学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:amuro111
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miRNA与其靶基因的作用机制十分复杂,因此,miRNA靶基因识别问题一直是miRNA研究领域的热点难题。该文基于CLASH数据集,提出了miRNA-靶位点配对序列特征,并使用随机森林建模。实验结果表明,本模型的Ace,Sen,Spe,Pre以及Mcc分别达到90.05%,89.47%,90.56%,90.43%和0.7998;ROC和PRC的AUC分别为0.954,0.958。相比已有方法,该方法表现出更加良好的性能,说明新引入的miRNA-靶位点配对序列特征对miRNA靶基因识别有很重大的影响。
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